卫生部于2003年启动了“建立我国专科医师培养和准入制度研究”课题，并于2004年批准了北京市卫生局开展专科医师培训工作试点。在此基础上，2006年２月，卫生部下发了《关于开展专科医师培训试点工作的通知》，出台了《卫生部专科医师培训暂行规定（征求意见稿）》、《卫生部专科医师培训基地认定管理办法》、《卫生部专科医师培养标准总则》、《专科基地标准细则》、《专科医师培养标准细则》等文件。选择有条件的地区和单位扩大试点范围，加强实践研究，以积累经验，逐步推广，探索建立适合我国国情的专科医师培养制度。 我校依照卫生部文件精神进行了专科医师培训基地的申报工作。

在为期两天的时间里，专家团对我校的四所附属医院逐一进行了考核，认真听取各医院院长的基地建设情况和住院医师规范化培训工作汇报，并分管理组和专科组以查阅管理文件、档案和工作记录，实地考察，住院医师技能考核，召开展管理人员座谈会及住院医师座谈会等形式进行现场评审，对培训试点基地的规章制度、设施设备、师资力量，各项核心指标、非核心指等进行了认真评估。２８个培训基地通过评审。在各附属医院评审反馈会上，专家团对各基地给予了较高的评价，同时也对基地的建设提出了宝贵的意见和建议。

近年来，我校在做好医学普通高等教育的同时，积极发挥学科与人才优势，开展毕业后教育和继续医学教育。该校目前有10所附属医院，其中4所为三级甲等综合性医院，1所三级甲等专科医院。从1990年开始，医院试行住院医师制度化培训；1998年全面铺开对所有专业住院医师进行学分制的“2+3”模式的制度化培训，2003年开始改为“3+2”模式；目前已建立了比较完善的轮转、出科考核、脱产理论学习和阶段考试的制度。2005年制订了符合卫生部“普通专科和亚专科医师培训细则”要求的规范化培训管理办法，并于当年开始向省内外招收临床医学本科毕业生，进行普通专科医师社会化、规范化培训，为医疗卫生事业培养出更多基本功扎实的优秀临床医师做出了努力。