吕建新副院长总结了近几年我校重点学科建设取得的可喜成绩，各重点学科在学术队伍、科学研究、人才培养等方面均成绩斐然，并培养了一批优秀的学科带头人，形成了一支相对稳定、结构合理的高素质、高水平的人才队伍。吕建新副院长也指出虽然我校各重点学科建设取得了一定的成绩，但有优势、特色的国内外领先的学科还不多，各学科之间发展不平衡，部分学科发展目标尚不够明确，自身发展定位也不够准确，一些学科方向需要进一步凝炼，学科特色有待凸现，要加快学科建设体制与机制的创新，探索学科建设的绩效管理。
研究生部卢中秋副主任就第二轮校级重点学科终期验收情况做了汇报。该轮校级重点学科于2004年启动建设，三年学校共投入建设经费350万元。根据《温州医学院重点学科管理办法》及《温州医学院重点学科评估指标体系》，对各学科在学科队伍、科学研究、人才培养、条件建设以及学术交流等方面进行了综合评分。其中眼视光学、生物化学与分子生物学成绩突出，麻醉学、普通外科学、围产医学、儿科学、骨外科学等一批学科取得较好成绩。
各学术委员会委员就重点学科建设发表了自己的意见。大家一致认为，校级重点学科取得了显著成绩，达到了预期目标。但也应该清醒认识到学校的学科建设还需进一步加强，尤其是在学科带头人的培养与引进、人才队伍的建设、学科方向的凝炼、高水平科研论文与成果的产出及经费投入等方面再上一个新台阶。
瞿佳院长在总结讲话中，一方面肯定了各级重点学科经过多年建设工作所取得成绩，提高了学校整体竞争力，提升了学校的地位，强调了学科建设在学校工作中的重要作用。同时,瞿佳院长对重点学科建设工作提出了明确要求：各级重点学科建设要及早规划，制定目标，要有咬定青山不放松的精神，认真总结建设工作中的经验和不足，临床要与基础结合，人才培养与引进结合，加大力度改善研究条件，打通平台为我所用，为大家所用，充分发挥学科带头人的作用，加强团队建设，希望各重点学科再接再厉、找准方向继续努力，更上一层楼，以扎实而卓有成效的工作促使我校学科的实力进一步增强，学科建设水平不断提高，争取更多学科跻身于国家级或省级重点学科之列。瞿佳院长还对第三轮校重点学科的建设工作做出了初步安排，要求各学科以评估考核为契机，大力促进第三轮重点学科的建设工作。
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